COVID-19-Associated Pulmonary Aspergillosis, Fungemia, and Pneumocystosis in the Intensive Care Unit: a Retrospective Multicenter Observational Cohort during the First French Pandemic Wave.

Aged Antifungal Agents / therapeutic use COVID-19 / epidemiology Coinfection / epidemiology Critical Care Female France / epidemiology Fungemia / drug therapy Galactose / analogs & derivatives Humans Intensive Care Units / statistics & numerical data Male Mannans / blood Middle Aged Pneumonia, Pneumocystis / drug therapy Pulmonary Aspergillosis / drug therapy Retrospective Studies SARS-CoV-2 Treatment Outcome
Aspergillus COVID-19 France aspergillosis critical care fungemia pneumocystosis

Journal

Microbiology spectrum
ISSN: 2165-0497
Titre abrégé: Microbiol Spectr
Pays: United States
ID NLM: 101634614

Informations de publication

Date de publication:
31 10 2021
Historique:
pubmed: 21 10 2021
medline: 17 11 2021
entrez: 20 10 2021
Statut: ppublish

Résumé

The aim of this study was to evaluate diagnostic means, host factors, delay of occurrence, and outcome of patients with COVID-19 pneumonia and fungal coinfections in the intensive care unit (ICU). From 1 February to 31 May 2020, we anonymously recorded COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA), fungemia (CA-fungemia), and pneumocystosis (CA-PCP) from 36 centers, including results on fungal biomarkers in respiratory specimens and serum. We collected data from 154 episodes of CAPA, 81 of CA-fungemia, 17 of CA-PCP, and 5 of other mold infections from 244 patients (male/female [M/F] ratio = 3.5; mean age, 64.7 ± 10.8 years). CA-PCP occurred first after ICU admission (median, 1 day; interquartile range [IQR], 0 to 3 days), followed by CAPA (9 days; IQR, 5 to 13 days), and then CA-fungemia (16 days; IQR, 12 to 23 days) (

Identifiants

DOI: 10.1128/Spectrum.01138-21 PMID: 34668768 PMC: PMC8528108
pubmed: 34668768
doi: 10.1128/Spectrum.01138-21
pmc: PMC8528108
doi:

Substances chimiques

Antifungal Agents 0
Mannans 0
galactomannan 11078-30-1
Galactose X2RN3Q8DNE

Types de publication

Journal Article Multicenter Study Observational Study Research Support, Non-U.S. Gov't

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

e0113821

Subventions

Organisme : Agence Nationale de la Recherche (ANR)
ID : 20CE35000701

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Auteurs

Stéphane Bretagne (S)

Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR2000, unité de Mycologie Moléculaire, Centre national de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Paris, France.
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Saint Louis, Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Paris, France.
Université de Paris, Paris, France.
ORCID: 0000-0001-6870-3800

Karine Sitbon (K)

Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR2000, unité de Mycologie Moléculaire, Centre national de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Paris, France.

Françoise Botterel (F)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne, Créteil, France.

Sarah Dellière (S)

Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR2000, unité de Mycologie Moléculaire, Centre national de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Paris, France.
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Saint Louis, Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Paris, France.
Université de Paris, Paris, France.
ORCID: 0000-0003-3821-1762

Valérie Letscher-Bru (V)

Service de Parasitologie et de Mycologie Médicale, CHU de Strasbourg, Strasbourg, France.

Taieb Chouaki (T)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU Amiens-Picardie, Amiens, France.

Anne-Pauline Bellanger (AP)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU Besançon, Besançon, France.

Christine Bonnal (C)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Universitaire Bichat, Paris, France.

Arnault Fekkar (A)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Groupe Hospitalier La Pitié-Salpêtrière, Service de Parasitologie Mycologie, Sorbonne Université, Inserm, CNRS, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Paris, France.
ORCID: 0000-0001-9954-075X

Florence Persat (F)

Hospices Civils de Lyongrid.413852.9, Service de Parasitologie et Mycologie Médicale, Hôpital de la Croix-Rousse, Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.

Damien Costa (D)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU Charles-Nicolle, Rouen, France.

Nathalie Bourgeois (N)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU de Montpellier, Montpellier, France.

Frédéric Dalle (F)

Laboratoire de Parasitologie Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon-Hôpital François Mitterrand, Dijon, France.

Florian Lussac-Sorton (F)

Department of Parasitology, Bordeaux University Hospital, Bordeaux, France.

André Paugam (A)

Université de Paris, Paris, France.
Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Hôpital Cochin, Paris, France.

Sophie Cassaing (S)

Service de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Purpan Toulouse, CHU Toulouse, Toulouse, France.

Lilia Hasseine (L)

Laboratoire de Parasitologie Mycologie CHU de Nice, Nice, France.

Antoine Huguenin (A)

Parasitologie Mycologie-Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Pôle de Biopathologie, CHU de Reims, Université de Reims Champagne Ardenne, Reims, France.

Nadia Guennouni (N)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Service de Bactériologie, Virologie, Parasitologie et Hygiène, Hôpital Necker-Enfants Malades, IHU Imagine, Paris, France.

Edith Mazars (E)

CH de Valenciennes, Laboratoire de Microbiologie, Valenciennes, France.

Solène Le Gal (S)

Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Hôpital de La Cavale Blanche, CHU de Brest, Brest, France.

Milène Sasso (M)

Laboratoire de Parasitologie Mycologie CHU Nîmes, Nîmes, France.
ORCID: 0000-0002-6539-8545

Sophie Brun (S)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Laboratoire de Parasitologie Mycologie Hôpital Avicenne, Bobigny, France.

Lucile Cadot (L)

Département d'Hygiène Hospitalière, CHU Montpellier, Montpellier, France.

Carole Cassagne (C)

IHU Marseille-Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection, Marseille, France.

Estelle Cateau (E)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU de Poitiers, Poitiers, France.

Jean-Pierre Gangneux (JP)

CHU de Rennes, Université de Rennes, Institut de Recherche en Santé, Environnement et Travail (IRSET), Rennes, France.

Maxime Moniot (M)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, France.

Anne-Laure Roux (AL)

Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Hôpital Raymond Poincaré Garches, Hôpital Ambroise Paré, Boulogne Billancourt, France.

Céline Tournus (C)

Laboratoire de Microbiologie, Centre Hospitalier de Saint-Denis, Saint-Denis, France.

Nicole Desbois-Nogard (N)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire de Martiniquegrid.412874.c, Fort-de-France, La Martinique, France.

Alain Le Coustumier (A)

Centre Hospitalier Intercommunal de Bigorre, Tarbes, France.

Olivier Moquet (O)

Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier de Beauvais, Beauvais, France.

Alexandre Alanio (A)

Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR2000, unité de Mycologie Moléculaire, Centre national de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Paris, France.
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Saint Louis, Assistance Publique-Hôpitaux De Paris (AP-HP), Paris, France.
Université de Paris, Paris, France.
ORCID: 0000-0001-9726-3082

Françoise Dromer (F)

Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR2000, unité de Mycologie Moléculaire, Centre national de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Paris, France.
ORCID: 0000-0003-1671-1475

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