Complete Genome Sequence of an Enterovirus Type C116 Strain Recovered from Urban Sewage and Determined by Deep Sequencing.


Journal

Microbiology resource announcements
ISSN: 2576-098X
Titre abrégé: Microbiol Resour Announc
Pays: United States
ID NLM: 101728794

Informations de publication

Date de publication:
17 May 2023
Historique:
medline: 12 4 2023
pubmed: 12 4 2023
entrez: 11 4 2023
Statut: ppublish

Résumé

Wastewater surveillance allowed the detection of an enterovirus (EV) type rarely reported in clinical settings. We detected an EV-C116 strain in a wastewater sample in France and characterized its complete genome. This virus was genetically closely related to African strains but distantly related to the only complete genome previously described.

Identifiants

pubmed: 37039665
doi: 10.1128/mra.00226-23
pmc: PMC10190210
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

e0022623

Déclaration de conflit d'intérêts

The authors declare no conflict of interest.

Références

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Auteurs

Maxime Bisseux (M)

CHU Clermont-Ferrand, 3 IHP, Centre National de Référence des Entérovirus et Parechovirus, Laboratoire de Virologie, Clermont-Ferrand, France.
Université Clermont Auvergne, LMGE CNRS 6023, UFR de Médecine et des Professions Paramédicales, Clermont-Ferrand, France.

Audrey Mirand (A)

CHU Clermont-Ferrand, 3 IHP, Centre National de Référence des Entérovirus et Parechovirus, Laboratoire de Virologie, Clermont-Ferrand, France.
Université Clermont Auvergne, LMGE CNRS 6023, UFR de Médecine et des Professions Paramédicales, Clermont-Ferrand, France.

Jonathan Colombet (J)

Université Clermont Auvergne, LMGE CNRS 6023, UFR de Médecine et des Professions Paramédicales, Clermont-Ferrand, France.

Jean-Luc Bailly (JL)

Université Clermont Auvergne, LMGE CNRS 6023, UFR de Médecine et des Professions Paramédicales, Clermont-Ferrand, France.

Cécile Henquell (C)

CHU Clermont-Ferrand, 3 IHP, Centre National de Référence des Entérovirus et Parechovirus, Laboratoire de Virologie, Clermont-Ferrand, France.
Université Clermont Auvergne, LMGE CNRS 6023, UFR de Médecine et des Professions Paramédicales, Clermont-Ferrand, France.

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